Rappel Conférence : 19 janvier. Notions de Phylogénie moléculaire

vendredi 4 décembre 2015
par  Raymond Ramousse
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Lionel DELAUNAY
Notions de Phylogénie moléculaire : application à la taxonomie et la systématique des Eucaryotes .
 
Mardi 19 janvier 2015, 19h, section Biologie Générale.

33 rue Bossuet, 3e étage. Interphone au 1er étage.

- Structure de l’ADN et l’ARN.
- Localisation dans la célulle : noyau, ribosomes, mitochondries
- Un type d’ADN, pour un type d’utilisation : microsatellites, gènes mitochondriques, gènes nucléaires, structures secondaires de l’ARN.
- Principe de comparaison des séquences : substitutions, alignement (Clustal et Muscle), p_distances.
- Substitutions multiples (saturation de l’information) : nécessité d’un modèle de substitution moléculaire.
- Les méthodes de fabrication d’un arbre : maximum de parcimonie, Neighbor-joining, maximum de vraisemblance et inférences bayesiennes.
- Solidité des arbres : bootstrap / probabilités postérieures.
- Exemples avec les logiciel MEGA et MrBayes.
- Applications : taxonomie, systématique, phylogéographie, refuges glaciaires ….
- Méthodes complémentaires : génétique des populations (haplotypes, allèles), statistiques « F » .

Lionel DELAUNAY est membre de la Société linnéenne de Lyon et éditeur de la revue de Faunistique, Taxonomie Systématique, morphologique & moléculaire Faunitaxys :
www.faunitaxys.fr