Bulletin mensuel de la Société linnéenne de Lyon. Tome 85, Fascicule 7-8, septembre-octobre 2016.

lundi 25 juillet 2016
par  Raymond Ramousse
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Bulletin mensuel de la Société linnéenne de Lyon. Tome 85, Fascicule 7-8, septembre-octobre 2016.

SOMMAIRE - CONTENTS
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Prudhomme Jean-Claude - Une étude locale de la biodiversité : inventaire des coléoptères du domaine de la fondation Pierre Vérots à Saint-Jean-de-Thurigneux (Ain, France). 4. Bruches, charançons, chrysomèles et autres phytophages. [A local study of biodiversity : inventory of the beetles of the property of Pierre Vérots Foundation in Saint-Jean-de-Thurigneux (Ain, France). 4 : bruchids, weevils, leaf beetles and other phytophagous beetles]. Bull. mens. Soc. linn. Lyon, 2016, 85 (7-8) : 210 – 240.
Résumé. – Une liste de 365 coléoptères phytophages rencontrés lors de l’inventaire des coléoptères du domaine de la Fondation Pierre Vérots à Saint-Jean-de-Thurigneux (Ain) est établie, commentée et comparée aux données anciennes et récentes disponibles pour la même région.
Mots clés. – Coléoptères phytophages, inventaire de la biodiversité, Dombes, Ain (France).
Abstract. – 365 phytophagous beetles species found in the property of Pierre Vérots Foundation in Saint-Jean-de-Thurigneux (Ain, France) are listed and compared to other available ancient and current data from the same regional area.
Keywords. – Phytophagous beetles, local biodiversity, Dombes, Ain (France).

Gruhn Gérald & Rivoire Bernard - Tubulicrinis incrassatus (Basidiomycota), première récolte en France métropolitaine. [Tubulicrinis incrassatus (Basidiomycota), a first collection from continental France]. Bull. mens. Soc. linn. Lyon, 2016, 85 (7-8) : 241 – 245.
Résumé - Tubulicrinis incrassatus, récolté sur résineux en France, est décrit et illustré. Cette espèce du groupe des Tubulicrinis à cystides non capitées et à sommet arrondi est proche de T. calothrix et T. borealis. Les différences avec ces taxons sont commentées.
Mots-clés. - Basidiomycota, corticiés, Tubulicrinis..
Summary - Tubulicrinis incrassatus is described and illustrated from a French collection made on conifer. This species of Tubulicrinis with non capited cystidia and obtuse apex is closed to T. calothrix and T. borealis. The differences with these species are discussed.
Keywords. - Basidiomycota, corticioid fungi, Tubulicrinis.

Béguinot Jean. - Extrapolation des inventaires de biodiversité incomplets : comment estimer au mieux le nombre d’espèces manquantes et prévoir l’effort additionnel d’échantillonnage requis pour réduire ce nombre. [Extrapolating the species accumulation curve for incomplete samplings : how to estimate accurately the number of missing species and reliably forecast the extra sampling effort required to reduce this number]. Bull. mens. Soc. linn. Lyon, 2016, 85 (7-8) : 246 – 258.
Résumé. – Approcher l’exhaustivité reste l’objectif idéal de tout inventaire ; cependant la difficulté de réaliser des échantillonnages d’espèces sub-complets est appelée à s’accroître à mesure que se présentent des groupes taxonomiques plus difficiles à traiter (par exemple la plupart des groupes de micro- invertébrés) et que, par ailleurs, de multiples priorités d’investigations viennent entrer en concurrence.
Pour autant, exploités de manière appropriée, les échantillonnages incomplets peuvent en dire plus qu’il ne semblerait au premier abord, et il apparaît possible d’en tirer un meilleur parti sous réserve de pouvoir réaliser des extrapolations numériques fiables.
D’ailleurs, les outils adaptés à l’exploitation dans ce sens des échantillonnages incomplets ne manquent pas et pêchent même plutôt par la diversité des solutions proposées et, corrélativement, par la disparité des résultats auxquels elles conduisent. Heureusement, la mise en évidence récente de contraintes mathématiques restreignant les formulations acceptables de la Courbe d’Accumulation des Espèces au fil de l’accroissement de taille de l’échantillon permet désormais de faire une sélection efficace parmi les différentes solutions proposées, en faveur de l’extrapolation la plus fiable.
Il devient ainsi possible (i) d’estimer avec une assez bonne exactitude le nombre d’espèces manquantes ayant échappé à l’échantillonnage et, partant, le niveau de richesse spécifique totale de l’ensemble inventorié ; (ii) d’extrapoler utilement la cinétique (progressivement ralentie) avec laquelle de nouvelles espèces viendraient s’ajouter à la liste déjà acquise par l’échantillonnage en cours, si celui-ci devait être poursuivi. Ceci permettant, du coup, de jauger objectivement le gain à attendre en termes de nouvelles espèces inventoriées, en fonction de l’effort d’échantillonnage supplémentaire à consentir. Toutes informations essentielles pour décider rationnellement de l’opportunité, soit de poursuivre, soit d’interrompre un échantillonnage en cours, compte tenu (i) du ratio gain attendu/effort additionnel requis, (ii) du degré d’incomplétude de l’échantillon en cours (vis-à-vis de la richesse spécifique totale estimée), (iii) de la concomitance possible (et même courante) de priorités d’inventaires concurrentes, soit en d’autres sites, soit en faveur d’autres groupes taxonomiques.
On illustre ici la mise en oeuvre de la procédure proposée d’extrapolation de la courbe d’accumulation des espèces permettant de « prolonger » numériquement l’échantillonnage déjà réalisé en considérant un récent inventaire de la faune cécidogène au sein du Parc National des Écrins. Cet inventaire rassemble les échantillonnages, inévitablement plus ou moins partiels, consacrés à chacun des quatre principaux ordres d’arthropodes cécidogènes : Acariens Trombidiformes, Hémiptères, Diptères, Hyménoptères.
Mots-clés. – Inventaire, échantillonnage incomplet, extrapolation, Courbe d’Accumulation des Espèces, estimation, richesse spécifique, Jackknife, Chao.
Abstract. – While approaching or even reaching total completeness remains the ideal goal of any species inventory, incomplete samplings are deemed to become more often the rule, as multiple priorities of investigations accumulate and new taxonomic groups are addressed that are significantly more difficult to cope with (such as (micro-) invertebrates, for example).However, once post-operated appropriately, incomplete samplings may provide far more data than it would seem and it is indeed possible to obtain valuable extra information from a reliable mode of extrapolation of the so-called Species Accumulation Curve.In fact, numerous tools designed for the exploitation of incomplete samplings have already been proposed in the literature but the concern, with these numerous different tools, is precisely the disparity of the results they provide respectively. Fortunately, the recent derivation of a specific mathematical relationship strongly constrains and restricts the range of relevant formulations of the Species Accumulation Curve. This, in turn, allows for efficient selection among the various tools proposed, thus highlighting the more reliable type of extrapolation of the Species Accumulation Curve beyond the ongoing sampling.Accordingly, this makes it possible : (i) to estimate, with fairly good accuracy, the number of missing species that escaped sampling and hence the total species richness of the sampled assemblage ; (ii) to extrapolate the (gradually slowing) pace at which new species are expected to add progressively to the list of already recorded species, according to the level of additional sampling effort and, thus, to objectively gauge the expected gain in terms of newly collected species according to the degree of additional sampling effort required.All these are essential information to help making a rational decision about the opportunity either to continue or to stop sampling operation, given (i) the ratio between the expected gain in new species and the required additional sampling effort, (ii) the degree of completeness of the current sample (with respect to the estimated total species richness), (iii) the usual co-occurrence of several other competing priorities of investigations, involving either other sites and/or other taxonomic groups to be further surveyed.Hereafter, I illustrate the implementation of the suggested procedure, aiming at reliably extrapolating the Species Accumulation Curve so as to “extend” numerically already achieved samplings. For this purpose, I consider a recent survey of the gall-forming fauna of the “Ecrins National Park”, located in south-west French Alps, including partial samplings of each of the four main orders of gall-forming arthropods : Acari-Trombidiformes, Hemiptera, Diptera and Hymenoptera.Keywords. – Survey, incomplete sampling, completeness, extrapolation , Species Accumulation Curve, estimator, species richness, Jackknife, Chao.

Villepoux Olivier - Jean-Claude LEDOUX (1943-2013). Bull. mens. Soc. linn. Lyon, 2016, 85 (7-8) : 259 – 260.

Krieg-Jacquier Régis, Deliry Cyrille et Roncin Pierre - Redécouverte de Ranunculus hederaceus L. 1753 (Ranunculales, Ranunculaceae) dans le département de l’Ain (France). [Rediscovery of Ranunculus hederaceus L. in Ain department, Eastern France (Ranunculales, Ranunculaceae)]. Bull. mens. Soc. linn. Lyon, 2016, 85 (7-8) : 261 – 271.
Résumé. – Après avoir été considéré comme disparu du département de l’Ain depuis la deuxième moitié du xxe siècle, Ranunculus hederaceus L. a été observé dans la région de Bourg-en-Bresse (Ain, France) en 2008, 2010 et ultérieurement. L’article relate ces observations et replace cette découverte dans le contexte régional.
Mots clés. – Ranunculales, Ranunculus hederaceus L., Bresse, Ain, Rhône-Alpes.
Abstract. – Though considered as extinct in Ain department since the last part of the XXth century, the Ivy-leaved Water Crowfoot (U.K.) or Long-Stalked Crowfoot (U.S.A.) Ranunculus hederaceus L. has been observed in Bourg-en-Bresse area in 2008, 2010 and after. This paper relates these observations and set the discovery in the regional context.
Keywords. – Ranunculales, Ranunculus hederaceus L., Bresse, Ain, Rhône-Alpes.

Couverture  : L’étang Praillebard et la prairie de Viaire-du-Loup à la Fondation Pierre Vérots à Saint-Jean-de-Thurigneux (Ain), un milieu humide de la Dombes très favorable à la biodiversité entomologique, mai 2016. Crédit  : J-P Rabatel
Cover : The Praillebard pond and Viaire-du-Loup meadow at the Foundation Pierre Vérots in Saint-Jean-de-Thurigneux (Ain), a Dombes wet medium very favorable to entomological biodiversity, in May 2016. Credit : J-P Rabatel


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